يُعد مجلس كلية طب الأسنان الهيئة الإدارية والاستشارية العليا للكلية، ويضطلع بمسؤولية وضع السياسات العامة والإشراف على البرامج الأكاديمية والبحثية والخدماتية، وضمان الجودة والاعتماد، وتعزيز التميز الأكاديمي والخدمة المجتمعية.  ويضم المجلس أعضاء من مختلف الأقسام والاختصاصات لضمان إدارة متكاملة وفعالة لكلية طب الأسنان.